从小异于常人的黑崎一护，在一次机缘巧合下遭遇女死神“朽木露琪亚”。露琪亚是将灵魂从现实世界引领到尸魂界的收魂者之一，他们为保护人类 不被“虚” 侵害，一直在与这些怪物战斗。在与一只异常强大的“虚” 战斗时，露琪亚身负重伤，无奈只能将死神 的力量暂时转给黑崎一护，让其代为战斗。两人经过一段时间的磨合后并肩战斗，终于战胜了当年害死一护母亲的“虚”，但在这期间，露琪亚的兄长朽木白哉强迫她不顾黑崎一护的生命安危收回法力。露琪亚为保护一护，拖延到与“虚”的战斗结束，并清除了一护的记忆...

这是一段连接过去与现在，穿越时空的「第二次初恋」故事。13年前由于父母因事故丧生，小城出身的姐姐茜放弃了和男友慎之介一同去东京，亲自抚养妹妹葵，而葵一直因为这件事对姐姐抱有愧疚。多年后的小城音乐节上，被邀请的著名歌手的伴奏音乐家竟然就是长年没有音信的慎之介。而同时在葵的面前，出现了穿越时空来到现在的18岁的慎之介“慎之”，他又吸引了她的爱慕……不可思议但又令人心碎的四角关系，连接过去与未来，「第二次的初恋」即将开始。

亚利西亚联邦研发的宇宙铁人——空迪因和陆迪因突然萌发了自主意识，他们袭击了布林克博士，意图实行反人类计划。但布林克博士死前下了一道限制，所以空迪因和陆迪因不得不以人类的形态活动。他们想夺取人造卫星武器“XV2”的力量，因此空迪因化身为“OSTO·Legacy”的白山静，前往天高找上了假面骑士部。她谎称需要借助假面骑士部的力量来阻止宇宙铁人的阴谋，将弦太朗一行人骗去了太空。但亚利西亚联邦特工——因娜布林克，联同她的拍挡黑骑士，一直在阻碍大家，数次交手后，流星和友子发现因娜似乎并不是他们想象中冷血无情的杀手。