哥斯拉突然从北极的冰中出现！哥斯拉击沉核潜艇海洋号，更破坏北极的军事基地后开始南下。同样的时候，在太平洋制药宣传部，那公司为提高节目的收看率打算使用发俄岛上的魔神，樱井和古江的两名宣传人员便去了发俄岛。他们发现岛上出现的魔神就是金刚。于是把他弄晕带到日本，不久在运送金刚的船遭日本政府拦截，但那时金刚突然从麻醉中苏醒，在运输船上跑出来，游向日本，而且更在那须高原初次与哥斯拉对决。第1回合以哥斯拉的放射火焰取得胜利，金刚被打败吗？

在某座都市的角落，有一个小小庭院中生长着小小树木的小小家庭。某天，爱撒娇的小君，迎来了刚刚出生的妹妹。双亲的爱被妹妹夺走，接踵而来的初体验给小君带来了困惑。这时，小君在庭院中遇到了称呼自己为“哥哥”、来自未来世界的妹妹“未来”。他在未来的引导下，展开了大冒险。在他面前的是前所未见的世界，是与自称曾经是“王子”的神秘男人、小时候的母亲以及青年时代的曾祖父的不可思议相遇。在那里，他首次得知的“家族之爱”的种种形式。

生活奢侈、懒散贪玩的新生代日本少女鸟山雪菜（土屋太凤 饰），经过一年的复读雪菜考上了雄飞工业大学。刚刚入学，雪菜邂逅了英俊的前辈高桥圭（高杉真宙 饰），之后在对方的邀请下加入了人力飞行兴趣小组。这个怪怪的小组有将近一百名成员，大家随后聚集到琵琶湖湖畔，为即将到来的夏季大会展开集训…

主人公宏伸在祖父的回收店铺中发现了一个能拍摄世界上最长全景照片的相机。从那刻开始，宏伸的黑白人生开始发生转。

某个大陆的、某个时代。大陆南北分割的战争结束了，世界走向了和平。在战争中作为军人的薇尔莉特•伊芙加登，怀抱着对她来说无比重要之人留下的“话语”，离开军队来到了大港口城市。踊跃的人群在排列着煤气灯的街道马路上来来往往地穿梭着。薇尔莉特在街道上找到了“代写书 信”的工作。那是根据委托人的想法来组织出相应语言的工作。她直面委托人、触碰着他们内心深处的坦率感情。与此同时，薇尔莉特在记录书信时，渐渐明白那“话语”的含义...

炎炎夏日，茂下町的烟花大会即将举行。就读于当地高中的及川奈砂（广濑铃 配音）并未沉浸在愉快祥和的气氛之中，她即将随母亲（松隆子 配音）搬家到另一个城市，心中满是失落。在某次即兴的游泳比赛时，奈砂击败同班同学岛田典道（菅田将晖 配音）和安昙祐介（宫野真守 配音）。随后她坦白喜欢祐介，希望烟花大会时能与对方一同游玩。可是祐介、典道随后卷入和朋友们关于“烟花到底是圆是扁”的争论中...

某天，六胞胎参加了高中同窗会。与成长为成熟大人、在社会上活跃的同学们重逢。对比之下发现自己完全不成器，他们因此大受打击，喝完闷酒之后睡着了。第二天早晨，清醒的小松等人注意到房间中的异变，来到街上。印入眼中的是与平日里不同却又有些熟悉的景色。众人正要怀疑这里是不是「过去世界」时，大裤衩告知他们「6人中的某人，在这个时代留下了巨大的遗憾」。为确认真相，他们要去见的人，是18岁时的自己…

前两部《魔法少女小圆》之剧场作品为12集电视版本之总集篇，其中计划包括重新剪辑的电视版内容和配乐，并会追加全新作画。前篇命名为“开始的故事”（始まりの物語），于2012年10月6日上映；后篇命名为“永远的故事”（永遠の物語），于一周后的2012年10月13日上映。

《魔法少女小圆剧场版 [前篇] 起始的物语》是日本2011年的原创动画《魔法少女小圆》剧场版动画系列的第一部作品。该剧场版和《魔法少女小圆剧场版 [后篇] 永远的物语》共同作为电视版总集篇。

鹿目圆，本来是一位拥有幸福日常生活的平凡人，直至为了解放残酷命运连锁的那天，她赌上身心去改变世界法则，拯救一众魔法少女。因为极度思念而奇迹般保着相关记忆的少女，晓美焰，在重组后的世界继续战斗，并一直盼望彼此带着值得怀缅的欢笑，再次相遇。于这样的一个世界中，魔法少女看到的究竟是希望，还是绝望？