路基艾尔、埃塔尔加等曾经的奥特战士宿敌接连苏醒，神秘的黑暗奥特战士也相继登场。新生代英雄们接连遭遇了不测，这一切的背后仿佛有一只无形的大手在操纵着。先是艾克斯和捷德遭遇黑暗奥特战士的袭击。随后，赶去地球支援格丽乔的赛罗和格丽乔一起，被奥特黑暗杀手给抓走了。罗索和布鲁被召唤到光之国，当兄弟二人得知妹妹被绑架时，头脑发热，不停泰罗的劝告，直接跑出去救人。结果半路就遭到了敌人的伏击。泰罗只好向在其他星球的利布特发出了支援请求，利布特收到消息后火速赶往救援。众位奥特战士发现此时不对劲后，集体回到光之国与泰罗等奥特

被称作奥特黑暗杀手的黑暗魔人，具有创造奥特战士的黑暗战士的能力。赛罗奥特曼和格丽乔奥特曼落入了黑暗杀手之手。 为了应对这场危机，泰罗奥特曼召集了“新世代英雄”，银河奥特曼、维克特利奥特曼、艾克斯奥特曼、欧布奥特曼、捷德奥特曼、罗索奥特曼、布鲁奥特曼，以及银河救援部队的利布特奥特曼作为辅助。 “新世代英雄”与“黑暗军团”之间的战斗将开始。