受到突如其来的怪兽袭击，地球上的人类几乎灭亡。为了人类最后的希望，由7名女性组成的TEAM·U守护着地球上最后的孩子。　　与此同时，因为听到呼唤而从其它宇宙前来的赛罗奥特曼、戴拿奥特曼和高斯奥特曼

故事设定为迪迦消失后的第8年—2017年主人公飞鸟信的父亲飞鸟一马，是在光中消失的宇航飞行员。当时飞鸟还和他的父亲约定回来看他打棒球。在此时他却从戴民长官那里得知了噩耗。飞鸟长大后，加入了地球和平联合组织TPC，在一次模拟战争中一举击败了超级胜利队的王牌飞行员由美村良，然而此时他却遇到了宇宙球体斯菲亚，虽然他驾驶战机奋力战斗，却寡不敌众。此时他看见了神秘的光，成为了在这个世界里继大古后的第二个光之巨人的人间体。

本作是高斯奥特曼剧场版三部曲的第二部。第一部是是高斯奥特曼第一次到地球的故事，同时也是高斯奥特曼第一次和春野武藏相遇的故事。本部是衔接高斯奥特曼TV版的故事往后发展的剧情，武藏在去观察朱兰行星的环境时发现朱兰行星的环境已经被怪兽破坏了，就在武藏遭遇危险时高斯奥特曼出现，救下了武藏。后来。武藏去参加好朋友的婚礼，在塞班岛上遇到了外星人晓和外星人仁。他们的故乡因为遭受宇宙怪兽的攻击而被毁灭，他们来到地球的海底世界，希望能够研究出让故乡自然再生的方法。然而，宇宙怪兽却派出侵略者前来袭击地球。危机时刻，消失已久的

大古是一个憧憬着电视节目《奥特曼》中的奥特曼形象，梦想是有朝一日能成为宇宙船船长的平凡少年。　　现在还在逐渐成长中，目前只是横浜市观光课的一名普通公务员。　　没错，本作的舞台是和之前的昭和·平成系列毫

故事发生在2017年的地球，飞鸟信（鹤野刚士 饰）的父亲飞鸟一马是一名宇航员，在一次任务之中下落不明，长大后的信继承了父亲对正义的追求，成为了地球和平联合组织的一员，在学习和训练之中展现出了过人的实力