主人公朝仓陆有一天入手了了捷德升华器与奥特胶囊，得到了变身成捷德奥特曼的力量。与此同时也知道自己继承了堕入邪恶的黑暗巨人贝利亚奥特曼的遗传基因。自己作为在地球长大的普通年轻人，知道了自己其实是贝利亚的儿子。捷德奥特曼，也就是朝仓陆的命运发生了巨大变化。

在父亲经营的小卖店工作的凑活海与大学生的凑勇海两兄弟与妹妹和父亲一同生活在一起，2人突然与在城市中出现的未知巨大生物（怪兽）遭遇！某日，兄弟二人获得了罗布回旋闪光和罗布水晶；以罗布回旋闪光及罗布水晶的力量2人奥特曼变身！罗索奥特曼＆布鲁奥特曼的战斗从此开始！

地球上住着很多偷偷隐居在此的宇宙人。只有很少一部分的人知道这个真相，一般民众并不知情。在这样的社会中主人公 “工藤优幸”就职于以解决宇宙人所产生的纠纷为主的民间警备组织“伊吉斯”每天为了和平而努力工作着。而他身上却隐藏着连自己都不知道的秘密，那就是附在其身上的泰迦奥特曼的光之粒子，泰迦奥特曼在优幸体内苏醒的那一刻，新的故事开始了。

由于太阳发射的奥特耀斑导致在沉睡在地球地底和海底的火花人偶（“スパークドールズ”）复活，为了应对接二连三出现的凶恶怪兽和侵略宇宙人，人类结成了装备有超科学机械的特搜防卫队Xio（吉奥）。特殊防卫队Xio队员大空大地在战斗中听到了迷之声，此后与神秘之光结合成为了“艾克斯奥特曼”。

有一天，马格玛星人及孪生怪兽来袭地球。当时身任地球防卫队MAC的队长诸星团，立即变身为赛文奥特曼迎战。但不敌，幸得雷欧奥特曼现身相助，才合力把怪兽赶走。在此战役中，诸星团因伤重而瘸腿，且损坏了奥特眼镜，便再不能够变身成赛文了。因此，他诚邀凤源（雷欧奥特曼）加入MAC，并委以保卫地球的重任。

传说在芭罗慈遗迹中封印着太古时代的地狱。然而对文物古迹有着强烈好奇心的黑崎硬是解开了该封印！随后，能将世界化为地狱的阎魔兽赛高古复活了！赛高古实力超群，在它强力的攻击下，艾克斯奥特曼的光芒消失了。地球会就此迎来末日吗？为了阻止赛高古，吉奥的队员们和考古学家玉城司教授抱着必死的决心前去寻回能封印赛高古的神秘之力。在千钧一发之际，玉城司的儿子悠斗那想要保护母亲的强烈愿望引发了奇迹。初代奥特曼、迪迦奥特曼就此登场！随后，吉奥与奥特英雄们合力对付以赛高古为首的怪兽军团，激战就此展开。

传说在芭罗慈遗迹中封印着太古时代的地狱。然而对文物古迹有着强烈好奇心的黑崎硬是解开了该封印！随后，能将世界化为地狱的阎魔兽赛高古复活了！赛高古实力超群，在它强力的攻击下，艾克斯奥特曼的光芒消失了。地球会就此迎来末日吗？为了阻止赛高古，吉奥的队员们和考古学家玉城司教授抱着必死的决心前去寻回能封印赛高古的神秘之力。在千钧一发之际，玉城司的儿子悠斗那想要保护母亲的强烈愿望引发了奇迹。初代奥特曼、迪迦奥特曼就此登场！随后，吉奥与奥特英雄们合力对付以赛高古为首的怪兽军团，激战就此展开。

捷德奥特曼击败他的父亲贝利亚奥特曼后，贝利亚的灵魂被封锁在异度空间，但其肉体却化为碎片飘散在宇宙，名为”恶魔碎片”。一名不知其真面目的恶徒正借着这些恶魔碎片危害四方，并将其魔爪伸向了光之国。恶魔碎片能让怪兽变得凶暴，恶徒利用恶魔碎片，它开始毁灭行星，使宇宙陷入了危机，而它的下一个目标是地球。赛罗奥特曼和他的徒弟泽塔奥特曼勇敢地站了出来，正面迎击敌人。经过一番激战，泽塔奥特曼独自一人追着怪兽前往地球。在地球上，人们为了对抗日常出现的怪兽组成了防卫军——怪兽应对机甲部队“军械库（STORAGE）”，在这支部队

世界上发生大规模地球人消失事件，进次郎和玲奈也同时消失了。消失的进次郎和玲奈被传送到了位于卫星轨道的外星人飞船上。自由记者光太郎因为调查“消失事件”之谜知晓了太多真相，后来惨遭灭口。但有人不希望光太郎就这样死去，于是复活了光太郎。复活后的光太郎变成了超人。外星人恐怖组织“黑暗之星”向世界发出了声明。他们以人质为要挟，要求获得地球的公民权。科特队为了救出人质，与“黑暗之星”的外星人展开了激烈的战斗。佐菲、杰克、艾斯也赶来帮助科特队解救人质。这一次奥特六兄弟，全员到齐！金古桥降临在涩谷大肆破坏城市。进次郎为了

世界上发生大规模地球人消失事件，进次郎和玲奈也同时消失了。消失的进次郎和玲奈被传送到了位于卫星轨道的外星人飞船上。自由记者光太郎因为调查“消失事件”之谜知晓了太多真相，后来惨遭灭口。但有人不希望光太郎就这样死去，于是复活了光太郎。复活后的光太郎变成了超人。外星人恐怖组织“黑暗之星”向世界发出了声明。他们以人质为要挟，要求获得地球的公民权。科特队为了救出人质，与“黑暗之星”的外星人展开了激烈的战斗。佐菲、杰克、艾斯也赶来帮助科特队解救人质。这一次奥特六兄弟，全员到齐！金古桥降临在涩谷大肆破坏城市。进次郎为了